染色質免疫沉淀測序 (ChIP-Seq) 是一種強大的工具，使研究人員能夠研究和了解蛋白質-DNA 相互作用以及它們對基因表達和細胞功能的影響。

ChIP-Seq 分析結合染色質免疫沉淀 (ChIP) 測定和下一代測序 (Seq) 來識別整個基因組中轉錄因子和其他蛋白質的 DNA 結合位點。 該技術為研究人員提供了對健康狀態(tài)和各種疾病中發(fā)生的基因調控事件的深入了解。

組蛋白

組蛋白是小而簡單的蛋白質，通常存在于細胞核中，將 DNA 鏈組織成核小體。這些核小體中發(fā)生的任何變化都被認為與細胞分裂和轉錄過程中染色質狀態(tài)和功能的改變有關。

組蛋白修飾

組蛋白經(jīng)歷了廣泛的翻譯后修飾， 這些主要發(fā)生在從核小體表面延伸的組蛋白的氨基末端尾部，至少有兩種機制被認為可以解釋這些修飾如何介導染色體的功能。

首先是修飾改變了組蛋白的靜電荷，導致其結構變化或改變了它與 DNA 的結合方式。  第二個表明這些修飾創(chuàng)造了蛋白質識別模塊可以結合的位點。  組蛋白修飾提供了一種表觀遺傳機制，可以調節(jié)一系列重要的健康和疾病相關過程。

表觀遺傳修飾是調節(jié)基因表達 和基因組功能的關鍵因素， 在各種類型的表觀遺傳修飾中，組蛋白修飾對于想要了解不同類型細胞、細胞階段和細胞環(huán)境中表觀遺傳和基因表達調控的研究人員具有重要意義。

組蛋白翻譯后修飾會影響許多基于染色質的反應，而那些影響基因表達的反應尤其重要，因為它們會影響整個轉錄程序。 中，翻譯后修飾的代謝異常與基因表達的錯誤調節(jié)有關體外研究，它們還與人類疾病有關，包括癌癥和免疫缺陷疾病。  因此，組蛋白標記的調節(jié)及其對修飾特異性結合蛋白關聯(lián)的影響是一個持續(xù)關注的領域。

確定組蛋白修飾的作用通常涉及分析修飾的豐度及其相互作用的結合伙伴。

組蛋白修飾的ChIP-Seq鑒定

ChIP-Seq 已成為一種穩(wěn)健、常規(guī)和全面的技術，用于研究和測量整個基因組中的各種翻譯后組蛋白修飾。 這些修飾，包括甲基化、 乙?；?、磷酸化和泛素化，都是基因組功能和保持其完整性的關鍵。

它們有助于沉默轉座因子，并在發(fā)育過程中調節(jié)某些基因。  不正確的修飾位置可能導致不健康的細胞表型，包括在衰老過程中看到的那些，在癌癥的情況下以及對具有挑戰(zhàn)性的營養(yǎng)或環(huán)境狀態(tài)的反應。

ChIP-Seq 分析中的一種常見方法是獲取實驗樣本（疾病樣本）和參考樣本（健康樣本）的 ChIP-Seq 配置文件，并比較它們以識別組蛋白修飾模式的差異。  然后這些可用于建立參與發(fā)育或疾病中發(fā)生的各種過程的基因或調節(jié)機制。

輝駿生物提供的ChIP染色質免疫共沉淀服務分為以下兩種：

1. ChIP qPCR，用于檢測某樣本中的誘餌蛋白和待測DNA片段是否結合；

2. ChIP seq，用于篩選某樣本中的誘餌蛋白可以結合哪些DNA區(qū)域。

ChIP服務優(yōu)勢*輝駿生物

ChIP實驗-客戶發(fā)表文獻

1.Zhuang Q. et al: NCoR/SMRT co-repressors cooperate with c-MYC to create an epigenetic barrier to somatic cell reprogramming. Nature Cell Biology.2018，IF=17.728. 【研究內容】：客戶通過RNA-seq證明了NCoR/SMRT共抑制子與多能位點結合，IP實驗、ChIP-qPCR分析進一步表明，NCoR/SMRT-HDAC3復合物在OSKM重編程中誘導組蛋白去乙?；亩嗄芪稽c。ChIP-seq分析發(fā)現(xiàn)，NCoR/SMRT中還存在著一個c-MYC結合基序。研究揭示了NCoR/SMRT共抑制子在重編程中的作用，并提出了c-MYC在這一過程中的雙重功能。 使用相關技術：染色質免疫共沉淀ChIP、chip qpcr實驗

2.Wang R.H. et al: A requirement for breast-cancer-associated gene 1(BRCA1) in the spindle checkpoint. PANS. 2004，IF=9.58. 【研究內容】：研究表明BRCA1缺陷型細胞的有絲分裂受到影響，存在紡錘體檢查點缺陷。客戶檢測和紡錘體檢查點密切相關的幾個基因，發(fā)現(xiàn)BRCA1缺陷型Mad2基因表達水平變化明顯，由此推測BRCA1是通過影響Mad2的表達，從而影響有絲分裂的。DNA pulldown及ChIP-qPCR實驗證實了BRCA1可以和Mad2啟動子結合，進一步研究發(fā)現(xiàn)BRCA1確實上調Mad2從而影響有絲分裂。 使用相關技術：chip技術服務、染色質免疫共沉淀ChIP-seq