ChIP-seq 是染色質(zhì)免疫沉淀測(cè)序的縮寫。從根本上說(shuō),ChIP-seq 是對(duì)與正在研究的 DNA 結(jié)合蛋白共沉淀的基因組 DNA 片段進(jìn)行測(cè)序。以這種方式最常研究的 DNA
結(jié)合蛋白是轉(zhuǎn)錄因子(例如,p53 或 NFκB)、染色質(zhì)修飾酶(例如,p300、組蛋白去乙?;福⑴c基因組 DNA
相互作用的修飾組蛋白(例如,組蛋白 3 三甲基化賴氨酸 4)和基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄機(jī)制的組成部分(例如,RNA 聚合酶 II)。從理論上講,該技術(shù)可以以公正的方式識(shí)別基因組中與特定 DNA 結(jié)合蛋白物理相關(guān)的所有 DNA 片段。 我們說(shuō)“不偏不倚”是因?yàn)槊庖叱恋碇械娜魏?
DNA 都會(huì)被測(cè)序,因此該技術(shù)不依賴于對(duì)精確 DNA 結(jié)合位點(diǎn)的先驗(yàn)知識(shí)。
1. ChIP qPCR,用于檢測(cè)某樣本中的誘餌蛋白和待測(cè)DNA片段是否結(jié)合;
2. ChIP seq,用于篩選某樣本中的誘餌蛋白可以結(jié)合哪些DNA區(qū)域。
ChIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)檢測(cè)服務(wù) | |||||
服務(wù)項(xiàng)目 | 服務(wù)內(nèi)容 | 結(jié)果交付 | 實(shí)驗(yàn)周期 | 客戶提供 | 價(jià)格 |
ChIP qPCR | Western blot檢測(cè)樣本(input)中的誘餌蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | 5-6周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 實(shí)驗(yàn)信息表(樣本信息,誘餌蛋白及待測(cè)DNA序列) | |
ChIP調(diào)取誘餌蛋白及其結(jié)合的DNA片段 (2組:實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組) | ChIP實(shí)驗(yàn)報(bào)告 | ||||
Western blot檢測(cè)ChIP產(chǎn)物中的誘餌蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | ||||
qPCR檢測(cè)ChIP產(chǎn)物中的待測(cè)DNA片段 | qPCR檢測(cè)數(shù)據(jù) | ||||
ChIP seq | Western blot檢測(cè)樣本(input)中的誘餌蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | 5-6周 | 實(shí)驗(yàn)樣本 誘餌蛋白的IP級(jí)抗體 實(shí)驗(yàn)信息表(樣本信息,誘餌蛋白序列) | |
ChIP調(diào)取誘餌蛋白及其結(jié)合的DNA片段 (2組:實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組) | ChIP實(shí)驗(yàn)報(bào)告 | ||||
Western blot檢測(cè)ChIP產(chǎn)物中的誘餌蛋白 | Western blot檢測(cè)圖 | ||||
seq檢測(cè)ChIP產(chǎn)物中的DNA片段并分析 | seq檢測(cè)結(jié)果、檢測(cè)和分析報(bào)告 | 9周 |
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